La colección de macroinvertebrados acuáticos hora de Limnología, contiene 14292 lotes (Marzo,2026) de especímenes que corresponden a dos reinos, siete Phyllum, 13 clases, 35 órdenes, 192 familias, 440 géneros, de esta colección el 88% se encuentra determinado a género y por el contrario lotes sin determinación representan tan solo el 2.3%. Entre estos los artrópodos son los más representativos (91%); siendo Ephemeroptera, Coleóptero, Diptera y Trichoptera los órdenes más abundantes en la colección, por otro lado las familias Elmidae (Coleoptera), Chironomidae (Diptera), Baetidae y Leptophlebiidae (Ephemeroptera) y finalmente Hydropsychidae (Tricoptera) las que mayor representatividad representan. Finalmente los géneros Anacroneuria (Perlidae), Smicridea y Leptonema (Hydropsychidae), Thraulodes (Leptophlebiidae) son los más abundantes. Las muestras provienen de 18 provincias siendo El Oro, Sucumbíos, Zamora Chinchipe y Orellana las que se encuentran mejor representadas; los lotes provienen de proyectos institucionales y externos que son de legalmente depositados